1、税收负担

    从社会层面看，增值税的推广是给大部分适应的企业减压，但是大部分校办企业因为自身的原因未能减轻负担。高校校办企业的财务管理缺乏准确性、全面性和科学性，更是缺少严格的标准，税收制度不健全，因此无法短期内适应新型纳税方式。在这个过渡时期，高校校办企业财税制度与管理方式都要进行大范围的改动去适应增值税的要求，以免自身脚步停滞不前。面对新的税收制度，高校校办企业需要长时间的过渡与适应，所带来的影响也是暂时的。       

    2、税收制度

    增值税的推广，最受益的是小规模高校校办企业，针对一般高校校办企业必须完善财税制度才能减少税收。从目前大多数校办企业的财务制度来看，缺乏财务战略发展目光和风险管控体系，这导致了混乱的税收局面，不仅减不了负担，反而增添了麻烦。加之缺乏专业素养的财会人员，不能够灵活处理校办企业会计实务，不了解增值税的抵消规则，校办企业的发展更加举步维艰，如履薄冰。所以校办企业一定要促进财税制度的改革与创新，注重企业税收发展的标准化和规范化。

    3、纳税过程

    “营改增”实行后，大多数企业的纳税过程变得不烦琐，但还是有些企业管理者对增值税纳税方式不够了解，导致没有体会到差异。这就造成了对增值税纳税方式没有深入了解，管理方式不会有所改变，与时代发展拉出了一定的差距。此外，增值税的兴起使得校办企业的成本核算也发生相应的改变，相关校办企业税务人员要求必须精通税法的核算要求。对于高校校办企业而言，其本身的会计核算就存在间题，愈加显得缴纳税收过程变得复杂。面对巨大的压力与挑战，高校校办企业需要引入专业人才，进行专业规划与发展，才可能步入真正的发展。