1、制定战略目标和风险系统管控

    校办企业虽然具有半行政性质，但是不能完全依照学校的行政指令发展，要根据自身的发展状况采取合适的财务投资、融资或收益分配方案。毕竟，学校的行政指令更多考虑的是有利自身，忽略了校办企业自身实际发展需求，也忽略了市场经济体制的发展。所以校办企业要建立自身独立的财务战略目标，发展不能完全依赖于所在高校，这样才能在市场经济洪流中屹立于不败之地。对于整个资本运行中，风险管控是企业经济发展的重中之重。风险控制的目的是消灭或减少风险事件发生所造成的损失，包括风险回避、损失控制、风险转移和风险保留。高校校办企业要做到用制度管理公司，创建独立、有效的内部控制，回避半行政化所存在的弊端。工作人员要及时梳理、记录企业资金活动、购销存活动等经济活动，系统分析所存在的风险间题及应对方案，保证经济活动中的风险都在管控范围之内。同时，可以借助自身资源优势，不定期委派高校管理者对企业进行审查，也可外聘审计人员到职定期审查，确保高校校办企业健康发展。        

    2、健全成本核算和绩效考核体制

    成本核算是否健全影响着财税制度的管理，成本核算必须要做到准确、全面、科学。第一，产权使用混淆现象。校办企业和高校要联合清查，确认资产的真正使用者，做好产权登记工作，科学记入财务账面。同时，调整财务工作，资产产权必须清晰，这样才达到成本核算的要求。第二，以低成本来核算高校活动的现象。这种现象在高校举办活动中经常发生，为了节省高校开支，以低于实际成本入账，这是属于不合法的避税行为，有一定的法律风险。高校校办企业在活动发生后，一定要以实际成本进行成本核算，确保成本的真实性。第三，工资薪酬不规范入账间题。对于校办企业不同工作人员工资要按照所属科目记入账面，要对人工成本科学核算，即便有的工资是高校代发，要保证成本核算中人工成本完整性。一个企业的高速发展是离不开优秀员工的贡献，要激发校办企业员工的积极性，所以要建立明确的奖惩绩效考核体系。对于外派人员、本企业的管理人员及普通人员采取双重考核制度，一方面，采取事业单位人员“德、能、绩、廉”方面考察;另一方面，采取企业KPI绩效考核，以品德、工作绩效、能力和态度为考察视角。这种方式调动了员工积极性，也增强了企业内部核心动力。

    3、引入科学管理体系和专业人员

    校办企业要想完善财税制度，必须充分发挥财务部门的作用，发挥财务管理在整个企业运营中的核心地位，最主要是提高财务人员的专业素养。一方面，校办企业通过培训方式及时更新老员工财务管理思维和方式，提升专业工作能力;另一方面，校办企业要适量引入理论知识丰富、有实战经验的专业财会人员，建立一支高素质精英管理团体。除了引入专业人员，校办企业还要更新科学管理体制。高校校办企业具有半行政管理模式，管理方式比较松散，灵活性不高，这都是存在的弊端。校办企业的第二任务是发展自身的价值，适当映入社会企、!卜的管理制度，增加考勤制度、岗位制度、奖惩制度、会议制度等一体的综合管理体系。